白菜全基因组研究成果发表 2011-09-04
深圳特区报讯 (记者 谭大跃 通讯员 逄莎莎)由中国农业科学院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所、深圳华大基因研究院主导，英国、韩国、加拿大、美国、法国、澳大利亚等国组成的“白菜基因组测序国际协作组”共同合作完成的白菜全基因组研究成果，昨天在国际权威杂志《自然－遗传学》上在线发表。
这是由中国科学家主导，通过国际合作完成的又一重大成果，标志着我国以白菜类作物为代表的芸薹属作物基因组学研究取得了国际领先的地位。
白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的蔬菜，其中结球白菜和小白菜是我国栽培面积和消费量最大的蔬菜作物。据了解，中国农业科学院蔬菜花卉研究所联合油料作物研究所和深圳华大基因研究院于2008年10月启动白菜基因组测序项目。此后鉴于我国开展的白菜基因组测序取得重大进展，2009年9月，英国、韩国、加拿大、美国、法国、澳大利亚等国家组成的“白菜基因组测序国际协作组”正式决定终止原有的所有测序活动，将中国测定的白菜基因组序列为A基因组参考序列。
在完成白菜基因组组装的基础上，我国科学家联合国际同盟进一步开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种相关的生物学分析。分析结果表明，白菜基因组大小约为485Mb，共包含4万多个基因；白菜的祖先种与模式物种拟南芥特别相似，它们大约在1300－1700万年前发生了分化，两者依然维持着良好的基因之间的线性对应关系；白菜基因组存在3个类似但基因密度明显不同的亚基因组，其中一个亚基因组密度显著高于另外两个亚基因组，推测白菜基因组在进化过程中经历了两次全基因组复制事件与两次基因丢失的过程。研究还发现，白菜在基因组发生复制之后，与器官形态变异有关的生长素相关基因发生了显著的扩增，白菜基因组复制导致了很多与形态变异有关的基因保留更多拷贝，这可能是白菜类蔬菜具有丰富的根、茎、叶形态变异的根本原因。这一成果对研究不同产品器官的形成与发育具有重要价值。
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